学院重视科研工作，成立了公共健康研究中心，下设环境与疾病研究所、毒理学研究所、流行病学研究所、营养保健医学研究所；成立卫生管理与政策研究中心，下设卫生信息与统计研究所、特定人群健康研究所、卫生工程管理研究所。凝炼研究方向，构建学术团队，形成了良好的科研平台和科研氛围。近年来，立项国家自然基金、教育部人文社会科学研究规划基金项目、国家统计局研究项目、省软科学、省科技发展计划等各级各类课题140余项，出版国家规划教材等各类教材、专著50余部，在国内外重要学术期刊上发表论文350余篇，获得山东软科学、省高校优秀科研成果等奖励120多项。

学院积极开展对外交流合作，与香港中文大学、山东大学等高校相关院系，军事医学科学院、山东省医药卫生科技信息研究所、浪潮集团、山东智博教育科技有限公司等科研院所及企事业单位建立了友好交流与合作关系，在人员交流、联合培养研究生、共建项目等方面取得了丰硕成果。